Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samt1A2BED8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samt1A2BED8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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