Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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