Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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