Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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