Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PDGFDQ9GZP0 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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