| RUNX2 | Q13950 | AL355306.2-209 | ENST00000437803 | 357 nt | TSL 2 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BMS1P22-202 | ENST00000440946 | 1160 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7AP61-201 | ENST00000443410 | 636 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP17-201 | ENST00000444617 | 696 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005002.1-201 | ENST00000447458 | 540 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012355.1-201 | ENST00000450290 | 769 nt | TSL 3 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPMTP4-201 | ENST00000450749 | 678 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL049874.2-201 | ENST00000492636 | 288 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P131-201 | ENST00000497298 | 483 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035404.1-201 | ENST00000497982 | 568 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02499-201 | ENST00000502291 | 763 nt | TSL 3 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010273.1-201 | ENST00000504129 | 946 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091860.1-201 | ENST00000505723 | 432 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008638.1-201 | ENST00000506035 | 866 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024132.2-201 | ENST00000506878 | 482 nt | TSL 3 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096734.1-201 | ENST00000511279 | 1128 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATG10-208 | ENST00000513634 | 618 nt | TSL 2 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097460.1-204 | ENST00000515026 | 764 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBCA-207 | ENST00000520039 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000756.1-201 | ENST00000532606 | 679 nt | TSL 2 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C14orf105-210 | ENST00000534126 | 1030 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007527.1-201 | ENST00000535528 | 313 nt | TSL 2 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE4A-203 | ENST00000545354 | 2149 nt | TSL 2 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092490.3-201 | ENST00000545370 | 572 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161751.1-201 | ENST00000555636 | 1044 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009554.1-201 | ENST00000559251 | 399 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DYNAP-202 | ENST00000585973 | 1102 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLIC4P2-201 | ENST00000601934 | 717 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015849.3-201 | ENST00000603981 | 488 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445222.1-201 | ENST00000607259 | 628 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EAF1-AS1-211 | ENST00000610011 | 316 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6719-201 | ENST00000622428 | 87 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002967.1-201 | ENST00000624203 | 539 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCT5-215 | ENST00000625723 | 135 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AJ009632.2-203 | ENST00000634708 | 1205 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAH7-202 | ENST00000409063 | 1845 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRLR-220 | ENST00000620785 | 11063 nt | TSL 5 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162425.1-201 | ENST00000423637 | 1525 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCF11-AS1-201 | ENST00000602322 | 1516 nt | BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AASDH-201 | ENST00000205214 | 3590 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AHNAK-202 | ENST00000378024 | 18787 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DCLRE1A-201 | ENST00000361384 | 4468 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD34C-201 | ENST00000421388 | 4951 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.8 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MUM1L1-202 | ENST00000357175 | 4173 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RGS4-202 | ENST00000367908 | 2606 nt | TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUPT3H-203 | ENST00000371460 | 2389 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NADK2-203 | ENST00000397338 | 3614 nt | TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC111188.2-201 | ENST00000529697 | 1387 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002525.1-201 | ENST00000624392 | 1622 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA15-201 | ENST00000607520 | 4325 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC112198.2-201 | ENST00000426589 | 6996 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP8-201 | ENST00000307179 | 4243 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FBXL13-207 | ENST00000455112 | 2274 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NXT2-201 | ENST00000218004 | 2692 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL9-201 | ENST00000295955 | 750 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-51P-201 | ENST00000364206 | 140 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | S100G-201 | ENST00000380200 | 455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P67-201 | ENST00000402896 | 478 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTF3P8-201 | ENST00000414577 | 526 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100848.1-201 | ENST00000417298 | 637 nt | TSL 3 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355357.1-201 | ENST00000433531 | 417 nt | TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139002.1-201 | ENST00000435281 | 902 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RHOT1P3-201 | ENST00000436571 | 331 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009263.1-201 | ENST00000441193 | 1239 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024597.1-201 | ENST00000442753 | 706 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073174.1-201 | ENST00000444155 | 415 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAJC19P8-201 | ENST00000452887 | 259 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160408.1-203 | ENST00000453568 | 631 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010976.1-211 | ENST00000454503 | 644 nt | TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092155.2-201 | ENST00000454675 | 477 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091180.1-201 | ENST00000462104 | 372 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL515P-201 | ENST00000463999 | 297 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | B4GALT4-AS1-201 | ENST00000470790 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRBV8-2-201 | ENST00000475637 | 270 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPSAP50-201 | ENST00000481955 | 852 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC000372.1-201 | ENST00000488818 | 646 nt | TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109462.1-201 | ENST00000491087 | 368 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL808P-201 | ENST00000496066 | 299 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TM4SF1-AS1-202 | ENST00000496491 | 754 nt | TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023050.1-201 | ENST00000498198 | 304 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005674.1-201 | ENST00000503493 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYL12BP2-201 | ENST00000503948 | 512 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010350.1-201 | ENST00000504908 | 231 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | F11-AS1-201 | ENST00000505103 | 1178 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5M14P-201 | ENST00000506803 | 618 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084871.1-201 | ENST00000508020 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004980.4-201 | ENST00000513375 | 203 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024132.3-201 | ENST00000513616 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LNX1-AS1-204 | ENST00000514364 | 495 nt | TSL 3 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC24P-201 | ENST00000516811 | 135 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL26L1-203 | ENST00000519239 | 679 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGHVIII-38-1-201 | ENST00000521454 | 282 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011853.2-201 | ENST00000526901 | 774 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYLK-221 | ENST00000583087 | 678 nt | TSL 4 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010422.4-201 | ENST00000601420 | 533 nt | TSL 3 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024075.3-201 | ENST00000601687 | 453 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137072.1-201 | ENST00000603444 | 466 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105254.2-201 | ENST00000603636 | 436 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093424.1-201 | ENST00000604999 | 338 nt | BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKCQ-AS1-208 | ENST00000608453 | 587 nt | TSL 5 BASIC | 4.79 | □□□□□ -1.64 | | |