Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ITGB3BPQ13352 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms