Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXA3O43365 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXA3O43365 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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HOXA3O43365 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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