Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms