Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms