Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms