Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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