Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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