Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SS18Q15532 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SS18Q15532 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SS18Q15532 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SS18Q15532 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms