Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms