Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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DDX39BQ13838 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
DDX39BQ13838 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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