Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL1Q13616 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms