Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPS29P62273 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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