Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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