Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms