Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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