Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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