Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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