Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms