Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PUM3Q15397 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PUM3Q15397 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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