Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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PDCD1Q15116 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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