Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms