Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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