Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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