Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
R3HDM1Q15032 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms