Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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