Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD13P35453 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms