Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPRGP23470 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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