Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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