Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms