Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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VAMP3Q15836 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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VAMP3Q15836 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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VAMP3Q15836 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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