Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TCOF1Q13428 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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TCOF1Q13428 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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TCOF1Q13428 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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