Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms