Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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