Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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