Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms