Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CSNK2A3Q8NEV1 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms