Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.7 ms