Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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