Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms