Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HOXD8P13378 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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