Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms