Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RFTN1Q14699 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms