Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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SGCGQ13326 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SGCGQ13326 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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