Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms